荣成水务集团有限公司设有党务综合部、计划财务部、稽查督办部、生产技术部、企管部、物资供应部、安全生产监管部、工会办公室8个部门,下辖荣成自来水分公司、石岛自来水分公司、好运角分公司、污水处理分公司、乡镇污水处理分公司、水质监测公司、环保科技分公司7个分公司。